5.2.1 Molecular Biological Properties
14-16 kDa Rice Allergens | References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allergen Nomenclature | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Isoallergens and Variants
At least 7 isoallergens of 14-16 kDa rice allergens which share > 67% amino acid sequence identity (2) fullfilling the definition of isoallergens of the WHO/IUIS Allergen Nomenclature Subcommittee (1) |
(1) King et al. 1994
(2) Matsuda et al. 1996 |
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Molecular Masses
14-16 kDa (SDS-PAGE) (1) |
(1) Matsuda et al. 1991 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Isoelectric
Points pI 6-8 (1)
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(1) Matsuda et al. 1991 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Sequence,mRNA, and
cDNA
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(1) Izumi et al. 1992
(2) Adachi et al. 1993 (3) Alvarez et al. 1995a (4) Oh et al. 1998 |
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cDNA library / recombinant Proteins
cDNA library: cDNA clones from maturing (1, 3, 4) and developing (5) seeds encoding rice allergens Expression in Escherichia coli:
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(1) Adachi et al. 1993
(2) Alvarez et al. 1995b (3) Matsuda et al. 1996 (4) Nakamura & Matsuda 1996 (5) Oh et al. 1998 |
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Posttranslational Modifications
Disulfide bonds: 5 disulfide bonds (1) |
(1) Nakase et al. 1998 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D-Structure
3D-Structure prediction of 16-kDa allergen: compactly folded protein, small hydrophobic core, rich in sheet and helix structures (1) |
(1) Nakase et al. 1998 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Function
alpha-amylase/trypsin inhibitor family (1) Inhibitory activity toward human salvary alpha- amylase, not to bacterial alpha- amylase (2) |
(1) Alvarez et al.
1995a, b
(2) Nakase et al. 1996 |
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Sequence Homology
14-16 kDa Rice allergens: sequence identities DNA > 80%, aa > 70% (2, 3) Alpha-amylase / trypsin inhibitors from wheat and barley: DNA sequence identities 20-40% (1, 3, 4, 5) Alpha-amylase / trypsin inhibitor family: well conserved 10 cystein residues region (1, 3) Castor bean storage protein: (1) Lipid transfer proteins: sequence of 25 C-terminal aa of 14-16 kDa rice allergen clones resembles plant lipid transfer proteins (2) |
(1) Izumi et al. 1992
(2) Alvarez et al. 1995a (3) Matsuda et al. 1996 (4) Nakamura & Matsuda 1996 (5) Nakase et al. 1998 |
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Localization
Maturing rice seeds (2) Albumin / globulin protein fractions (1) |
(1) Matsuda et al.
1991
(2) Matsuda et al. 1996 |
5.2.2 Allergenic Properties
14-16 kDa Rice Allergens | References |
Frequency of Sensitization
IgE-binding to 14-16 kDa rice allergens in 67-100% of patients (1) IgE-binding to 14-16 kDa isoallergens (2): a) 14-15.5 kDa allergen in 64% b) RA14 (~16 kDa) gene family, 3 isolated fractions: 41% (for 1 fraction) and 29% (other 2 fractions) c) RA17 (14-15.5 kDa) in 29% (17 rice allergic patients, RAST) |
(1) see 6.1 Sensitization
to Rice Allergens
(2) Nakase et al. 1996 |
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